MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pE2348-2

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011602	AT	3	6	2	7	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011602	CAT	3	9	31	39	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011602	ATT	4	12	117	128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011602	TCA	2	6	154	159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274579
5	NC_011602	CGC	2	6	305	310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274579
6	NC_011602	CG	3	6	335	340	0 %	0 %	50 %	50 %	215274579
7	NC_011602	GTG	2	6	433	438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215274579
8	NC_011602	ATC	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274579
9	NC_011602	TCG	2	6	514	519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215274579
10	NC_011602	GCAG	2	8	542	549	25 %	0 %	50 %	25 %	215274579
11	NC_011602	CAT	2	6	575	580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274579
12	NC_011602	GCG	2	6	591	596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215274579
13	NC_011602	CG	3	6	605	610	0 %	0 %	50 %	50 %	215274579
14	NC_011602	T	6	6	675	680	0 %	100 %	0 %	0 %	215274579
15	NC_011602	GCT	2	6	687	692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215274579
16	NC_011602	TCTG	2	8	761	768	0 %	50 %	25 %	25 %	215274579
17	NC_011602	GC	4	8	788	795	0 %	0 %	50 %	50 %	215274579
18	NC_011602	GCC	3	9	849	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274579
19	NC_011602	CA	3	6	881	886	50 %	0 %	0 %	50 %	215274579
20	NC_011602	GGC	2	6	923	928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215274579
21	NC_011602	GAAA	2	8	932	939	75 %	0 %	25 %	0 %	215274579
22	NC_011602	TCA	2	6	991	996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011602	T	8	8	1033	1040	0 %	100 %	0 %	0 %	215274580
24	NC_011602	GTG	2	6	1105	1110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215274580
25	NC_011602	CGC	2	6	1146	1151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274580
26	NC_011602	TCA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274580
27	NC_011602	AGG	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215274580
28	NC_011602	AGG	2	6	1240	1245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215274580
29	NC_011602	CGG	2	6	1282	1287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215274580
30	NC_011602	TCTG	2	8	1292	1299	0 %	50 %	25 %	25 %	215274580
31	NC_011602	GCA	2	6	1334	1339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274580
32	NC_011602	CTT	2	6	1451	1456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215274580
33	NC_011602	CGC	2	6	1477	1482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274580
34	NC_011602	GTT	2	6	1551	1556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215274580
35	NC_011602	TGG	2	6	1588	1593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215274580
36	NC_011602	GGC	2	6	1633	1638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215274580
37	NC_011602	CAG	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274580
38	NC_011602	GC	3	6	1721	1726	0 %	0 %	50 %	50 %	215274580
39	NC_011602	GCCTT	2	10	1777	1786	0 %	40 %	20 %	40 %	215274580
40	NC_011602	GCC	2	6	1828	1833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274581
41	NC_011602	AGA	2	6	1957	1962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215274581
42	NC_011602	TGA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215274581
43	NC_011602	GGGAG	2	10	2009	2018	20 %	0 %	80 %	0 %	215274581
44	NC_011602	CT	3	6	2081	2086	0 %	50 %	0 %	50 %	215274581
45	NC_011602	GC	3	6	2228	2233	0 %	0 %	50 %	50 %	215274581
46	NC_011602	GAT	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215274581
47	NC_011602	ATG	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215274581
48	NC_011602	CAT	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274581
49	NC_011602	CAT	2	6	2350	2355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274581
50	NC_011602	GGCT	2	8	2369	2376	0 %	25 %	50 %	25 %	215274581
51	NC_011602	GCC	2	6	2420	2425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274581
52	NC_011602	GAC	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274581
53	NC_011602	TC	3	6	2502	2507	0 %	50 %	0 %	50 %	215274581
54	NC_011602	GTT	2	6	2813	2818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215274582
55	NC_011602	TCA	2	6	2830	2835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274582
56	NC_011602	GGC	2	6	2844	2849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215274582
57	NC_011602	CCG	2	6	2862	2867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274582
58	NC_011602	GCC	2	6	2969	2974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274582
59	NC_011602	TTC	2	6	2988	2993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215274582
60	NC_011602	ATCCCG	2	12	3126	3137	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	215274582
61	NC_011602	GCC	2	6	3151	3156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274582
62	NC_011602	TACA	2	8	3194	3201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011602	TGCC	2	8	3243	3250	0 %	25 %	25 %	50 %	215274583
64	NC_011602	GCCA	2	8	3264	3271	25 %	0 %	25 %	50 %	215274583
65	NC_011602	ATG	2	6	3337	3342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215274583
66	NC_011602	TTA	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215274583
67	NC_011602	CAG	2	6	3360	3365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274583
68	NC_011602	TTC	2	6	3386	3391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215274583
69	NC_011602	TGA	2	6	3423	3428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215274583
70	NC_011602	ACT	2	6	3457	3462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274583
71	NC_011602	CCA	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215274583
72	NC_011602	ACC	3	9	3481	3489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215274583
73	NC_011602	CAT	2	6	3528	3533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274583
74	NC_011602	ACC	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215274583
75	NC_011602	TA	3	6	3658	3663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011602	TAC	2	6	3676	3681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011602	T	6	6	3709	3714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011602	CTG	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215274584
79	NC_011602	AC	3	6	3793	3798	50 %	0 %	0 %	50 %	215274584
80	NC_011602	ATGGC	2	10	3818	3827	20 %	20 %	40 %	20 %	215274584
81	NC_011602	A	6	6	3919	3924	100 %	0 %	0 %	0 %	215274584
82	NC_011602	AGG	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215274584
83	NC_011602	CAG	2	6	4064	4069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274584
84	NC_011602	GCA	2	6	4084	4089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274584
85	NC_011602	GAG	2	6	4151	4156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215274584
86	NC_011602	AAC	2	6	4161	4166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215274584
87	NC_011602	A	7	7	4209	4215	100 %	0 %	0 %	0 %	215274584
88	NC_011602	CAA	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215274585
89	NC_011602	ACC	2	6	4358	4363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215274585
90	NC_011602	GCAT	2	8	4402	4409	25 %	25 %	25 %	25 %	215274585
91	NC_011602	TTC	2	6	4478	4483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215274585
92	NC_011602	GAA	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011602	T	7	7	4699	4705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011602	ATT	2	6	4750	4755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011602	A	8	8	4824	4831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011602	GTT	2	6	5075	5080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215274586
97	NC_011602	CAT	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274586
98	NC_011602	GTT	2	6	5124	5129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011602	A	6	6	5243	5248	100 %	0 %	0 %	0 %	215274587
100	NC_011602	GCA	2	6	5250	5255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274587
101	NC_011602	CAG	2	6	5265	5270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274587
102	NC_011602	GCG	2	6	5336	5341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215274587
103	NC_011602	ACGG	2	8	5356	5363	25 %	0 %	50 %	25 %	215274587
104	NC_011602	AGA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215274587
105	NC_011602	C	6	6	5450	5455	0 %	0 %	0 %	100 %	215274587
106	NC_011602	GTG	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215274587
107	NC_011602	C	6	6	5679	5684	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_011602	GCA	2	6	5763	5768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011602	AGAT	2	8	5795	5802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011602	T	6	6	5942	5947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011602	AAG	2	6	5990	5995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011602	GCA	2	6	6099	6104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011602	A	6	6	6115	6120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011602	AT	3	6	6126	6131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011602	GA	3	6	6141	6146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.